اندو باکس یک جعبه یا محفظه‌ی مخصوص در دندانپزشکی است که برای نگهداری، سازماندهی و استریل کردن ابزارهای مورد استفاده در درمان ریشه (اندودنتیکس) طراحی شده است. این جعبه معمولاً شامل بخش‌های مجزایی برای نگهداری فایل‌های روتاری، گیتس، اسپریدر، پلاگر و سایر ابزارهای اندودنتیک است. اندو باکس‌ها از مواد مقاوم و قابل استریل مانند استیل ضدزنگ یا پلاستیک‌های مخصوص ساخته می‌شوند تا بتوان آن‌ها را در دستگاه اتوکلاو قرار داده و به‌طور کامل ضدعفونی کرد.

یکی از ویژگی‌های مهم اندو باکس، امکان دسته‌بندی و مرتب‌سازی ابزارها بر اساس اندازه و نوع کاربرد آن‌هاست که به دندانپزشک کمک می‌کند تا هنگام درمان، ابزار مورد نیاز خود را به سرعت پیدا کند. برخی مدل‌های پیشرفته دارای نشانگرهای رنگی یا کدگذاری شده‌اند تا تشخیص سایز و نوع فایل‌ها را آسان‌تر کنند. استفاده از اندو باکس علاوه بر افزایش نظم و سرعت کار، به بهداشت و کنترل عفونت در محیط دندانپزشکی نیز کمک می‌کند.